Reorganize free-programming-books-ja.md (#4846)

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* [セキュリティ](#%e3%82%bb%e3%82%ad%e3%83%a5%e3%83%aa%e3%83%86%e3%82%a3)
* [その他の話題](#%e3%81%9d%e3%81%ae%e4%bb%96%e3%81%ae%e8%a9%b1%e9%a1%8c)
* [ソフトウェアアーキテクチャ](#%e3%82%bd%e3%83%95%e3%83%88%e3%82%a6%e3%82%a7%e3%82%a2%e3%82%a2%e3%83%bc%e3%82%ad%e3%83%86%e3%82%af%e3%83%81%e3%83%a3)
* [ソフトウェア品質](#%e3%82%bd%e3%83%95%e3%83%88%e3%82%a6%e3%82%a7%e3%82%a2%e5%93%81%e8%b3%aa)
* [ソフトウェア開発方法論](#%e3%82%bd%e3%83%95%e3%83%88%e3%82%a6%e3%82%a7%e3%82%a2%e9%96%8b%e7%99%ba%e6%96%b9%e6%b3%95%e8%ab%96)
* [ソフトウェア品質](#%e3%82%bd%e3%83%95%e3%83%88%e3%82%a6%e3%82%a7%e3%82%a2%e5%93%81%e8%b3%aa)
* [データベース](#%e3%83%87%e3%83%bc%e3%82%bf%e3%83%99%e3%83%bc%e3%82%b9)
* [並列プログラミング](#%e4%b8%a6%e5%88%97%e3%83%97%e3%83%ad%e3%82%b0%e3%83%a9%e3%83%9f%e3%83%b3%e3%82%b0)
* [機械学習](#%E6%A9%9F%E6%A2%B0%E5%AD%A6%E7%BF%92)
* [機械学習](#%e6%a9%9f%e6%a2%b0%e5%ad%a6%e7%bf%92)
* [正規表現](#%e6%ad%a3%e8%a6%8f%e8%a1%a8%e7%8f%be)
* [組み込みシステム](#%e7%b5%84%e3%81%bf%e8%be%bc%e3%81%bf%e3%82%b7%e3%82%b9%e3%83%86%e3%83%a0)
* [理論計算機科学](#%e7%90%86%e8%ab%96%e8%a8%88%e7%ae%97%e6%a9%9f%e7%a7%91%e5%ad%a6)
* [Android](#android)
* [AppleScript](#applescript)
* [AWK](#awk)
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* [NoSQL](#nosql)
* [Objective-C](#objective-c)
* [OCaml](#ocaml)
* [openFrameworks](#openframeworks)
* [Perl](#perl)
* [PHP](#php)
* [Symfony](#symfony)
@ -73,7 +74,6 @@
* [Standard ML](#standard-ml)
* [Swift](#swift)
* [Tcl/Tk](#tcltk)
* [Theoretical Computer Science](#theoretical-computer-science)
* [TypeScript](#typescript)
* [VBA](#vba)
* [Vim](#vim)
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* [データベース](http://www.ipa.go.jp/files/000018652.pdf) - 独立行政法人 情報処理推進機構(IPA) (PDF)
#### プログラミングの理論
* [計算機プログラムの構造と解釈](http://sicp.iijlab.net/fulltext/) - Gerald Jay Sussman et al.
#### 並列プログラミング
* [インテル コンパイラー OpenMP 入門](http://jp.xlsoft.com/documents/intel/compiler/525J-001.pdf) - 戸室隆彦 (PDF)
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* [組込みソフトウェア開発向け コーディング作法ガイドC++言語版]](http://www.ipa.go.jp/files/000005142.pdf) - 独立行政法人 情報処理推進機構(IPA) (PDF)
#### 理論計算機科学
* [計算機プログラムの構造と解釈 第二版](https://sicp.iijlab.net/fulltext/) - Gerald Jay Sussman et al.
### Android
* [Android Open Text book](https://github.com/TechBooster/AndroidOpenTextbook) - TechBooster
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* [江添亮のC++入門](https://ezoeryou.github.io/cpp-intro/) - 江添亮
### Clojure
* [Clojureスタイルガイド](https://github.com/totakke/clojure-style-guide) - Bozhidar Batsov, Toshiki TAKEUCHI(翻訳)
* [Modern cljs(翻訳中)](https://github.com/TranslateBabelJapan/modern-cljs) - Mimmo Cosenza, @esehara(翻訳)
* [逆引きClojure](https://github.com/making/rd-clj) - Toshiaki Maki
### CoffeeScript
* [CoffeeScript 言語リファレンス](http://memo.sappari.org/coffeescript/coffeescript-langref)
@ -255,13 +262,6 @@
* [正規表現リファレンスCoffeeScript)](http://kyu-mu.net/coffeescript/regexp/) - 飯塚直
### Clojure
* [Clojureスタイルガイド](https://github.com/totakke/clojure-style-guide) - Bozhidar Batsov, Toshiki TAKEUCHI(翻訳)
* [Modern cljs(翻訳中)](https://github.com/TranslateBabelJapan/modern-cljs) - Mimmo Cosenza, @esehara(翻訳)
* [逆引きClojure](https://github.com/making/rd-clj) - Toshiaki Maki
### Common Lisp
* [Common Lisp 入門](http://www.nct9.ne.jp/m_hiroi/xyzzy_lisp.html#abclisp) - 広井誠
@ -323,19 +323,19 @@
* [JGGUG G*Magazine](http://grails.jp/g_mag_jp/) - JGGUG(日本Grails/Groovyユーザーグループ) (PDF, EPUB)
### Gradle
#### Gradle
* [Gradle 日本語ドキュメント](http://gradle.monochromeroad.com/docs/) - Hayashi Masatoshi, Sekiya Kazuchika, Sue Nobuhiro, Mochida Shinya ([PDF](http://gradle.monochromeroad.com/docs/userguide/userguide.pdf))
* [ビルドツールGradleスタートアップガイドの紹介](https://www.ntts.co.jp/column/tec/java_03/) - 鈴木雅貴
### Grails
#### Grails
* [Grailsフレームワーク 日本語リファレンス](http://grails.jp/doc/latest/) - T.Yamamoto & Japanese Grails Doc Translating Team. Special thanks to NTT Software.
* [Grailsを用いたファイルアップローダ作成](https://www.ntts.co.jp/column/tec/java_02/) - 須藤悠
### Spock Framework
#### Spock Framework
* [G*ワークショップZ May 2013 - Spockハンズオンの資料](https://github.com/yamkazu/spock-workshop/tree/master/docs) - Kazuki YAMAMOTO
* [Spock Framework リファレンスドキュメント](http://spock-framework-reference-documentation-ja.readthedocs.org/ja/latest/) - Peter Niederwieser, Kazuki YAMAMOTO
@ -647,11 +647,6 @@
* [Tcl/Tk入門](http://aoba.cc.saga-u.ac.jp/lecture/TclTk/text.pdf) - 只木進一 (PDF)
### Theoretical Computer Science
* [計算機プログラムの構造と解釈 第二版](https://sicp.iijlab.net/fulltext/xcont.html) - Alan J. Perlis
### TypeScript
* [TypeScript Deep Dive 日本語版](https://typescript-jp.gitbook.io/deep-dive/) - basarat, yohamta(翻訳)